小智这回去橘子群岛就除了皮卡丘，只带上了驹刀小兵，比雕，四小只，以及肯泰罗的变异种首领。
小智从大木博士那里接过了达马兰奇会长给他的大师球，共携带了30颗大师球，小智决定回来之后。
先去把基格尔德收服了，先有一个实力强大的神兽护体再说吧，超梦它们被小智留下来镇着岛屿，不能让外人随意进入。
大木博士说道：“小智，你们去橘子群岛，顺便帮我去内木博士研究所一趟，你好像说有一个神秘的精灵球，怎么研究都没有效果？也没有进展，十分特殊，还无法通过传送器传送回来。我现在要逐究研究z手镯了，恐怕无法前去，否则我早就亲自过去看看了，就只能麻烦你们。”
小智点了点头，说道：“放心吧，大木博士放心研究就行，那颗神秘的精灵球，我们会给你带过来的，我听说橘子群岛要举办橘子联盟，所以我要带着迷你龙他们去训练，参加联盟可能要晚一些时间回来。”
大木博士说道：“哪个特殊的精灵球？其实也不是那么着急了，还有一件更重要的事情就是龙鳞水蛇，玉面狮王他们，我不是很了解论文，只能你来写，写完你可以用电脑以电报的形式发给我，联盟要用，记得要快。”
小智说道：“好的，大木博士，过个两三天我就发过去，我们现在就要出发了。”
离开了真新镇小智，他们打算坐船或坐飞机前往橘子群岛。
走到半路的途中，小刚发现了不对，说道：“你们有没有感觉有点奇怪，这里安静的似乎有点可怕了，怎么连一只虫和鸟都没？”
小霞和小智这才反应到，经磐森林应该是鸟，虫神奇宝贝们的圣地才对。
小智说道：“确实安静的有点不像话了，从我们刚刚过来应该会有很多的神奇宝贝才对。小智放出了波导，察觉到方圆十里的神奇宝贝们全都畏畏缩缩的躲了起来。
小霞说道：“这里的虫神奇宝贝应该很多，对比重虫神奇宝贝，像这种那么安静的森林，反而更可怕。”
“皮卡皮”皮卡丘用手指向上指了指，示意小智们向上看。
小智三人抬头一看，发现是一只大嘴雀正在带领着所有的猎雀在天空翱翔。
小智通