中，人的行为并不完全受理性支配。蜈蚣博弈假设参与者完全理性，只追求利益最大化，但实际情况可能受到情感、企业价值观、社会责任等诸多因素的影响。比如有些企业可能会为了维护长期的合作关系而放弃短期利益最大化的选择。
- 信息假设的局限：蜈蚣博弈通常假设双方对收益情况有完全的了解，但在实际商业活动中，信息往往是不对称的。这会导致参与者很难像理论中那样准确地进行逆向归纳。例如在技术创新合作中，一方可能对技术的市场前景、成本估算等信息掌握得更加准确，另一方可能因为信息缺失而做出错误的博弈策略选择。
- 忽略合作红利：它过于强调不合作的风险，可能会使企业或个人低估持续合作所能带来的巨大红利。在实践中，长期稳定的合作关系有可能产生协同效应、降低交易成本等诸多好处，而这些在蜈蚣博弈简单的模型中没有得到充分体现。