一挥手示意。郑森这才将郑芝龙带了回去。
紧跟着，一道早就拟好的圣旨便被宣读开来：“南宁侯郑芝龙，旧疾复发，难以胜任东番水师提督重任。朕念其劳苦功高，准其所请，由郑森袭爵。
郑森平叛有功，赐名成功。宜大力整顿水师，使其为我大明东南劲旅。”
郑成功顺利带着亲信返回府邸，一到府上，便立刻采取行动，将郑芝龙软禁起来。
他下令严禁郑芝龙再插手家中事务以及军事相关事宜，以绝后患。
田川氏见丈夫被囚，心急如焚，苦苦哀求儿子郑成功高抬贵手，可郑成功心意已决，对母亲的请求充耳不闻。
无奈之下，田川氏只好退而求其次，转而恳请儿子放过自己的胞弟田川次郎 。
郑成功见状，耐心劝说道：“母亲，弟弟改姓田川，原本是为了延续田川家的香火，同时协助我郑家维系与日本的贸易往来，这我一直都清楚。
然而此次他竟接受叛军的贿赂，还低价售卖违禁物资，这般行径，依照律法当斩。他犯下如此大错，我们郑家都要受其牵连，被他拖累。
母亲又何必苦苦相逼，让我为难呢！”
田川氏听后，自知儿子所言在理，却又心疼弟弟，一时无言以对，只能默默以泪洗面，哀伤不已。
郑成功看着母亲伤心的模样，心中不忍，最终只好答应会尽力保全田川次郎的性命。
但他也提出条件，作为交换，田川家族必须公开宣布拥护他成为郑家家主，而且双方的贸易关系要一如既往地维持下去。
在接下来不到半个月的时间里，郑成功展现出非凡的决断力和强硬手段。
对于军中那些不服管教的将官，他果断下令斩杀，绝不姑息；同时，他又着手遣散军中的老弱残兵，对军队进行了一次大整顿。
经过此番调整，东番水师规模维持在五百艘舰船，兵员数量为一万人，并且规定战时需服从东海舰队的统一调遣。
处理完军队事务后，郑成功又以表达感谢为名，从缴获的物资中拨出两百万两，郑重地交付给凌志。
同时，他言辞恳切地声明，从今往后，郑家必将世世代代忠于燕王，忠于凌氏，矢志不渝。