生容器，但被鼬以幻术制服，并被斩断一手，后在药师兜的掩护下撤离。后来又因为与晓组织的目的不同最终离开晓。
后来大蛇丸集结势力在田之国建立了自己的忍者村－音忍者村，标记是八分音符，其势力范围位于火之国的北方。他的重要部下有红莲、鬼灯水月、重吾（北方据点）、香磷（南方据点）、药师兜、音忍五人众（即辉夜君麻吕、多由也、次郎坊、鬼童丸、左\/右近）等。
中忍考试 十二年后，此时的大蛇丸已进入中年时期，他与第四代风影·罗砂结盟，二人联手进攻木叶，其行动称为“木叶崩溃计划”。
他以部下药师兜作间谍潜入木叶隐村，而他自己也伪装成一名来自草隐村的女中忍考生混入木叶隐村。在死亡森林中大蛇丸遇到宇智波佐助，因为大蛇丸打算以佐助的身体当转生容器，所以给了佐助天之咒印，并预言佐助将会为报宇智波一族被灭族之仇去找他追求力量。
大蛇丸刺杀四代风影 后来，他暗杀第四代风影，并伪装成风影，让自己完全控制砂忍的行动。 在第三场中忍正式考试中，伪装成四代目风影的大蛇丸受三代目火影特意邀请，来到木叶隐村中忍选拔会场与三代目火影一同观赏这场淘汰赛，期间由大蛇丸的四名得力部下多由也、次郎坊、鬼童丸、左近右近伪装成两名砂隐忍者作为护卫，由于宇智波佐助为赶来参加考试，三代火影多次推迟考试时间后佐助仍未来参加，随后三代火影决定取消其资格，但因“四代目风影”的劝阻，三代火影打消了此念头。
木叶崩溃行动 对战三代火影 五十岁时他跟木叶的原盟友·第四代风影结盟，二人合谋攻击木叶，其行动称为“木叶崩溃计划”。大蛇丸则另有图谋，在兜和君麻吕的帮助下，大蛇丸暗杀了罗砂并伪装成风影的模样，他成功挑起砂忍和木叶忍者之间的战斗，直到中忍考试结束，马基等人才发现罗砂的尸体。 他以部下药师兜作间谍潜入木叶忍村，而他自己也伪装成一名来自草忍的中忍试女考生混入该村。
并于死亡森林中遇到宇智波佐助，由于打算以他的身体作转生容器，故意给了佐助天之咒印，并预言佐助将会为报宇智波一族被灭之仇去找他寻求力量。
后来，他成功挑动起砂忍和木叶忍者之间的战斗后，